На выбор материала для применения его в той или иной химической установке во многом влияет его совместимость с окружающей средой. Изготовление установки и ее эксплуатация не должны наносить вред здоровью людей и окружающей среде. Желательно, чтобы имелась возможность повторной обработки материала или его естественного распада в условиях окружающей среды.
Часто используемые в химическом производстве материалы, такие как сталь, медь или алюминий, можно считать вполне экологически чистыми. Они не ядовиты и могут повторно использоваться после расплавления и придания им новой формы. Существую материалы, например свинец, которые требуют применения особых мер осторожности при обработке.
Некоторые виды пластмасс, например, полиуретан, поливинилхлорид, политетрафторэтилен и эпоксидная смола могут создавать проблемы для окружающей среды. Неправильное их сжигание может вызвать выделение во внешнюю среду ядовитых веществ, кроме того, в своем большинстве пластики на данный момент повторно не используются. В химическом производстве по возможности необходимо избегать вредных для здоровья веществ, таких как асбест или средства очистки.